一、大環境（檢測室）
1.檢測時，窗戶和空調要關閉，或用酒精對房間進行噴霧消毒，避免房間內空氣流通影響超凈臺內部環境（最好在有通排風系統的恒溫恒濕無菌間進行操作）。
2.如果在原來的原料微生物檢測室進行檢測，要定期開啟紫外燈，對房間進行殺菌。
二、小環境（超凈工作臺）
1.定期清潔初效過濾器，要及時更換。
2.檢測前，將超凈臺內部進行清潔，用75%酒精進行擦拭消毒，并提前半小時將超凈臺紫外燈打開，對超凈臺內部環境進行殺菌。
3.關紫外燈，開風機，調整合適進風量，風量不可過低。
4.每次檢測后，要對超凈臺內部進行清理、清潔，并用75%酒精進行擦拭消毒。
5.紫外燈根據其使用壽命要及時更換。
6.檢測同時，要做上相應菌落檢測的環境空白。
7.檢測區域的選擇：
a、一般在距離超凈臺外沿的1/3-2/3區域進行無菌操作；
b、要在酒精燈火焰的外焰保護區域進行操作。
三、工器具的潔凈度
1.玻璃器皿：采用干熱滅菌方式進行滅菌。
2.檢測用剪刀、勺子等物品要做到檢測專用，不可與其它操作器具混用，使用時，先用75%酒精消毒，再采用灼燒方式進行滅菌。
3.接種針（環）采用灼燒方式進行滅菌，但要注意檢測時要先將接種針（環）進行冷卻。
HD-M-Discover型微生物質譜鑒定分析系統,基質輔助激光解吸電離飛機時間質譜（MALIDI-TOF）技術的出現在很大方面彌補了傳統方法的不足。質譜儀具有高靈敏度、高特異性、高準確度和高通量等特點，加上其自動化和檢測成本低的優勢，已經逐漸在微生物各領域實驗室被廣泛應用。在細菌、真菌（酵母菌/絲狀真菌）、分枝桿菌等微生物鑒定中發揮了重要作用。
